Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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