Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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