Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms