Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pggt1bQ8BUY9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms