Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms