Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem260Q8BMD6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms