Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy1Q8BIJ7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy1Q8BIJ7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms