Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra5Q8BHJ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms