Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms