Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Liat1Q810M6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Liat1Q810M6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms