Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms