Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnupnQ80W37 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms