Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap100Q80VN0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap100Q80VN0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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