Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rassf6Q80UQ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rassf6Q80UQ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms