Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms