Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ScocQ78YZ6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ScocQ78YZ6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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