Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmed3Q78IS1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms