Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Topbp1Q6ZQF0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms