Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms