Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gja6Q6S5G4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms