Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudcd1Q6PIP5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms