Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmeff1Q6PFE7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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