Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HltfQ6PCN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HltfQ6PCN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms