Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CltbQ6IRU5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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