Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms