Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms