Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdc3Q64519 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Sdc3Q64519 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms