Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Top2bQ64511 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms