Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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