Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms