Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga7Q61738 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga7Q61738 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms