Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd3Q61060 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms