Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasa3Q60790 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasa3Q60790 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms