Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rabl6Q5U3K5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rabl6Q5U3K5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms