Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsr1Q5SWD9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms