Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SynrgQ5SV85 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms