Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh12Q5RJH3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh12Q5RJH3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms