Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bhlha9Q5RJB0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms