Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim58Q5NCC9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms