Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8bQ5DU41 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms