Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Rtl5Q5DTT4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtl5Q5DTT4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Rtl5Q5DTT4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Rtl5Q5DTT4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
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Rtl5Q5DTT4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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Rtl5Q5DTT4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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