Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C2cd3Q52KB6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
C2cd3Q52KB6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms