Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10488Q4KL05 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10488Q4KL05 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms