Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zmat1Q3V0C1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zmat1Q3V0C1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms