Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ttc9Q3V038 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ttc9Q3V038 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ttc9Q3V038 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ttc9Q3V038 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ttc9Q3V038 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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