Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc27Q3V036 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc27Q3V036 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms