Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc114Q3UX62 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms