Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28047Q3US59 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28047Q3US59 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms