Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp560Q3URI6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms