Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms